Vaksin influenza merupakan vaksin yang mampu melindungi dari penyakit flu. Vaksin ini biasanya diberikan setiap satu tahun sekali. Untuk mendapat vaksin ini, masyarakat dapat mengakses fasilitas kesehatan ( faskes) yang menyediakannya. RSUD prambanan merupakan salah satu faskes yang menyediakan dan melayani vkasinasi influenza untuk masyrakat umum.
Permintaan masyarakat yang sangat tinggi terkait hal ini, membuat RSUD Prambanan gemcar untuk melaukan pelayanan vaksinasi influenza. Saat ini, RSUD Prambanan menjalin kerjasama dengan beberapa puskesmas di Kabupaten Sleman dalam upaya vaksinasi calon jamaah haji. Selain itu, pelayanan juga dapat diakses di Klinik MCU yang buka setiap ahri senin s,d sabtu berdasarkan ajdwal pendaftarann yang ditetapkan.